Un caso di carenza di manganese nell'uomo è stato riportato in un volontario che aveva ricevuto una dieta purificata contenente 0,1 mg/die di manganese. Ha presentato una dermatite transitoria, un'ipocolesterolemia e un incremento dei livelli di fosfatasi alcalina. Ha perso circa il 60% delle sue riserve corporee di manganese in 2 sett., ma non si sono verificate ulteriori perdite durante altre 4 sett. di dieta carente. Il deficit di manganese non è stato documentato nella letteratura clinica.

L'intossicazione da manganese è abitualmente limitata alle persone che estraggono e raffinano questo minerale; l'esposizione prolungata causa dei sintomi neurologici che assomigliano al morbo di Parkinson o alla malattia di Wilson.