(Per la trattazione della giardiasi, dell'infezione da botriocefalo lato [difillobotriasi], l'ascariasi e l'anchilostomiasi, v. Cap. 161)

Le infezioni acute batteriche e virali possono provocare un malassorbimento transitorio, probabilmente a causa di un danno temporaneo e superficiale dei villi e dei microvilli. Le infezioni batteriche croniche del piccolo intestino sono rare, a parte la sindrome dell'ansa cieca, la sclerodermia e i diverticoli. I batteri intestinali possono utilizzare la vitamina B₁₂ contenuta nella dieta, interferire, forse, con i sistemi enzimatici e provocare un'infiammazione superficiale.