Molti funghi e muffe possono causare infezioni opportunistiche, potenzialmente anche letali in pazienti immunocompromessi. Questi solo raramente colpiscono persone con difese immunitarie integre. I funghi tendono a causare fungiemia e coinvolgimento focale della cute e di altri siti. Trichosporon beigelii e Blastoschizomyces capitatus colpiscono particolarmente pazienti neutropenici. La Candida (Torulopsis) glabrata può causare fungiemia, infezioni urinarie e, occasionalmente, polmonite o altre lesioni focali e tende a essere più resistente agli azolici o all’amfotericina B della C. albicans. I bambini e gli adulti debilitati che ricevono iperalimentazione EV contenente lipidi sono suscettibili alla fungemia da Malassezia furfur. Il Penicillium marneffei è stato riconosciuto come agente opportunistico in pazienti con AIDS nel Sud-Est asiatico e ne sono stati riscontrati casi negli USA. Le lesioni cutanee da P. marneffei possono ricordare il mollusco contagioso. Varie muffe ambientali, tra cui specie di Fusarium e di Scedosporium, possono causare lesioni vasculitiche focali che mimano l’aspergillosi invasiva specialmente nei pazienti neutropenici. La diagnosi specifica richiede colture e identificazione di specie e ciò è di cruciale importanza perché non tutti questi organismi rispondono ad ogni singolo farmaco antimicotico. Per esempio, le specie di Scedosporium sono tipicamente resistenti all’amfotericina B.

Devono ancora essere definiti regimi ottimali di terapia antimicotica per ogni membro di questo gruppo di funghi opportunisti.